發(fā)布時間:2024-12-06 閱讀次數(shù):408次
在微生物研究的眾多領(lǐng)域中,菌種的準(zhǔn)確分離鑒定始終是關(guān)鍵環(huán)節(jié)。Wickerhamiella(擬威客酵母菌)作為主要來源于環(huán)境樣本的芽殖酵母屬,已被發(fā)現(xiàn)多達(dá)40種。然而,從人類臨床樣本中分離出的該屬酵母通常僅有三種:W. infanticola、W. pararugosa和W. sorbophila。
? 白念珠菌(W. pararugosa)從中國的人糞便、意大利的口腔和日本的唾液中被分離出來,之前的研究報告稱,白念珠菌會引起血液感染;
? W. sorbophila從人類糞便中分離出來;
? W.infanticola從德國嬰兒耳朵里分離出來。
Wickerhamiella tropicalis(熱帶擬威客酵母菌)于2020年首次從環(huán)境樣本中被分離出來(Sakpuntoon等人,2020),此前從未在人類樣本中有所發(fā)現(xiàn)。在本病例報告中,令人矚目的是,研究者首次在引發(fā)嚴(yán)重感染的血液培養(yǎng)中成功分離出W. tropicalis。酵母樣真菌和酵母菌往往會導(dǎo)致免疫功能低下(如接受免疫抑制劑、化療或器官移植)患者的血流感染。鑒于這些菌種對抗真菌藥物的敏感性各異,快速正確鑒定菌種類型,并及時啟動恰當(dāng)?shù)闹委煼桨?,對于改善患者的預(yù)后意義重大。
MALDI-TOF
W. tropicalis臨床分離和鑒定案例
2022年,研究者從一位有B細(xì)胞前體淋巴母細(xì)胞白血病病史的6歲日本女性血液樣本中分離出了熱帶擬威客酵母菌(W. tropicalis)。最初通過常規(guī)微生物檢查形態(tài)學(xué)鑒定為念珠菌屬,隨后通過核糖體DNA(rDNA)的內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)測序,最終鑒定為熱帶擬威客酵母菌(W. tropicalis)。該分離物的ERG11和FKS1中的氨基酸替換分別與念珠菌對唑和棘白菌素的耐藥性有關(guān),且對氟康唑和米卡芬凈表現(xiàn)出中度耐藥性。幸運的是,病人通過米卡芬凈治療獲得成功。
此外,MALDI-MS檢測到三個熱帶擬威客酵母菌(W.tropicalis)特有的新峰,這表明MALDI-MS分析在常規(guī)微生物檢查中能夠?qū)崿F(xiàn)對擬威客酵母菌的快速檢測。臨床實驗室常規(guī)鑒定酵母樣真菌的方法,如革蘭氏染色和真菌分離培養(yǎng),難以準(zhǔn)確的鑒定到真菌菌種類型?;驕y序雖為鑒定菌株的常用良法,但出結(jié)果時間相對MALDI-TOF快速微生物鑒定方法更長。MALDI-TOF能夠?qū)崿F(xiàn)快速、高通量且準(zhǔn)確地鑒定微生物菌種。在本研究中,采用島津MALDI-8020成功識別Wickerhamiella菌種特有峰,并發(fā)現(xiàn)了三個與之相關(guān)的新峰。
對每種真菌提取物采集了五張單獨的質(zhì)譜圖,質(zhì)量范圍從m/z 2000到20000。生物標(biāo)志物搜索和峰值匹配使用島津eMSTAT Solution軟件進(jìn)行。
不同菌種代表性指紋圖譜,峰值分別與峰值列表中的峰值對應(yīng)
指紋圖譜質(zhì)量區(qū)間m/z 6000至6600部分的放大圖顯示,與W. tropicalis相比,W. sorbophila 和W. spandovensis峰2、3和4的m/z值變化很小
峰值列表
MALDI-TOF
小結(jié)
該研究使用島津MALDI-8020建立了快速鑒定Wickerhamiella菌種的方法。使用MALDI-MS建立數(shù)據(jù)庫對于臨床實驗室鑒定引起嚴(yán)重感染的酵母樣真菌至關(guān)重要。
島津臺式機(jī)MALDI EasyCare系列,EasyCare功能可輕松進(jìn)行自我維護(hù),增加實驗室正常運行時間,提高分析效率。其體積小巧,能安裝于任何實驗室。尤其適合有大量樣本分析需求的實驗室,如微生物鑒定、成像分析、生物制藥QC等領(lǐng)域。
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參考資料:
文獻(xiàn)題目《Isolation and identification of m tropicalis from blood culture by MALDI-MS》
期刊Frontiers in Cellular and Infection Microbiology
作者Satomi Takei1,2, Kanae Teramoto2,3,et al.
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