基于電子捕獲裂解 / 電子轉(zhuǎn)運(yùn)裂解串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)的蛋白質(zhì)組學(xué)研究 *
孫瑞祥 1)** 董夢秋 2)** 遲 浩 1) 楊 兵 2) 秀麗蘊(yùn) 1) 王樂珩 1) 付 巖 1) 賀思敏 1)
( 1) 中國科學(xué)院計算技術(shù)研究所,智能信息處理重點實驗室,北京 100190; 2) 北京生命科學(xué)研究所,北京 102206)
[摘要]
蛋白質(zhì)組學(xué)的興起帶動了質(zhì)譜技術(shù)的快速發(fā)展,而質(zhì)譜技術(shù)的進(jìn)步則拓寬了蛋白質(zhì)組學(xué)研究問題的廣度. 最近 10 年內(nèi),肽段或完整蛋白質(zhì)在質(zhì)譜儀中的裂解技術(shù)———電子捕獲裂解(electron capture dissociation, ECD)與電子轉(zhuǎn)運(yùn)裂解(electrontransfer dissociation, ETD)逐漸發(fā)展起來. ECD 和 ETD 在蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用,特別是在蛋白質(zhì)的翻譯后修飾鑒定和“自頂而下(Top-down)”的完整蛋白質(zhì)裂解研究中已經(jīng)展示出了誘人的前景. 對 ECD 和 ETD 的基本原理、質(zhì)譜特點、儀器實現(xiàn)、數(shù)據(jù)解析算法與軟件開發(fā),以及在蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用進(jìn)展等方面進(jìn)行了比較系統(tǒng)全面的闡述,并對當(dāng)前的研究問題、面臨的技術(shù)挑戰(zhàn)與未來的發(fā)展趨勢等方面作了深入剖析.
關(guān)鍵詞 電子捕獲裂解,電子轉(zhuǎn)運(yùn)裂解,碰撞誘導(dǎo)裂解,串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù),計算蛋白質(zhì)組學(xué)
生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展
Progress in Biochemistry and Biophysics
2010, 37(1): 94~102 新技術(shù)講座