發(fā)布時(shí)間:2020-07-17 閱讀次數(shù):988次
近年來,使用MALDI-TOF飛行時(shí)間質(zhì)譜進(jìn)行微生物鑒定的方法已經(jīng)普及,并廣泛用于臨床微生物鑒定、食品和藥品工業(yè)領(lǐng)域質(zhì)量控制以及微生物研究領(lǐng)域。然而這種常規(guī)方法,也有個(gè)別菌種鑒定起來有局限性,例如鑒定混合菌或孢子形成的細(xì)菌。我們嘗試換種方法來進(jìn)行微生物的鑒定。通過MS/MS檢測(cè)胰蛋白酶消化的細(xì)菌蛋白和數(shù)據(jù)庫(kù)檢索的肽段來鑒定蛋白,鎖定菌種種類,且可以從多個(gè)峰中選擇特定的峰,用于蛋白混合物鑒定。我們使用胰蛋白酶珠進(jìn)行蛋白質(zhì)的快速酶解,使用島津MALDImini-1數(shù)字離子阱MS/MS功能來鑒定芽孢桿菌。
MALDImini-1基質(zhì)輔助激光解吸電離數(shù)字離子阱質(zhì)譜儀。數(shù)字離子阱(DIT)技術(shù)是島津獨(dú)有的原創(chuàng)技術(shù),緊湊迷你的體積,僅占用A3紙大小面積,即可實(shí)現(xiàn)MS多級(jí)的檢測(cè)。數(shù)字離子阱是由數(shù)字信號(hào)驅(qū)動(dòng)的四極離子阱,使用矩形波RF捕獲離子,更容易調(diào)諧頻率,無需使用高壓即可捕獲高質(zhì)量離子。質(zhì)量范圍上限可達(dá)70000m/z,可拓展更廣泛的應(yīng)用。
將已形成芽孢的枯草芽孢桿菌取樣,按上圖工作流程制備樣品。胰蛋白酶珠2ul,在濕潤(rùn)環(huán)境和37℃溫度下,30分鐘,對(duì)芽孢蛋白進(jìn)行酶解。通過使用胰蛋白酶珠可縮短通常需要數(shù)小時(shí)以上的酶解時(shí)間。酶解完成后,添加基質(zhì)溶液1ul,干燥后MALDImini-1即可開始MS,MS/MS檢測(cè)。
MS/MS離子數(shù)據(jù)庫(kù)檢索結(jié)果
通過MALDImini-1的MS/MS功能與能夠快速酶切的胰蛋白酶珠消化芽孢蛋白質(zhì)方法組合,特異性多肽序列可以對(duì)芽孢桿菌進(jìn)行快速鑒定。也有報(bào)道對(duì)食物中毒菌蠟狀芽孢桿菌和高傳染性炭疽芽孢桿菌進(jìn)行了相同的研究。
新聞稿內(nèi)容來源:島津應(yīng)用新聞NO.B112
應(yīng)用文獻(xiàn)下載